مصطفی عاقلی دارای سند کارشناسیارشد روابط بینالملل از مؤسسۀ تحصیلات عالی افغانستان میباشد. ایشان نویسندۀ نزدیک به ۳۰ مقالۀ علمی-پژوهشی در حوزۀ روابط بینالملل و علوم سیاسی است. استاد عاقلی همچنین نویسندۀ دو کتابِ «مبانی سیاست» و «اصول روابط بینالملل» میباشد. ایشان ویراستار ۱۰ کتاب علمی و تحقیقی در نهادهای گوناگون پژوهشی است. ایشان یکی از نویسندگان و ویراستاران علمی «روابط بینالمللی افغانستان» همراه دکتر میرویس بلخی و کاکه تاجیک نیز میباشد. حوزۀ پژوهشی مورد علاقۀ ایشان مطالعات جهان جنوب و تئوریهای روابط بینالملل است. آقای مصطفی عاقلی پژوهشگر مرکز تحقیقات و مدرّس روابط بینالملل دانشگاه افغانستان بوده است و تا کنون در چندین سمینارعلمی در سطح ملی، منطقهای و جهانی شرکت کرده است.