مرکزتحقیق: مطابق لایحه وظایف استادان، هر استاد سه وظیفه اصلی دارد تدریس، تحقیق و فعالیت های که در کمیته های داخل پوهنحی و دیپارتمنت سپرده میشود. بنابرین تحقیقات یکی از وظایف اساسی استادان میباشد تا درکنار تدریس، یک نهاد علمی بتواند به مرکز تولیدو توسعه علم نیز مبدل گردد. پوهنتون مولانا جلال الدین محمد بلخی دارای مرکز تحقیقات علمی بوده که در سطح پوهنتون فعالیت دارد و کمیته های فرعی آن در سطح پوهنحی ها نیز فعال میباشد.